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게놈 슬롯 머신 룰 분석

우리의 실험실은 고구마 및 기타와 같은 것들에 대한 슬롯 머신 룰 육종 연구를 수행합니다. 엄청난 양의 DNA 서열 데이터를 출력하는 고속 시퀀서 (차세대 시퀀서)를 사용하여 해충 저항성 및 수율과 같은 중요한 농업 특성에 대한 DNA 마커를 개발하고 슬롯 머신 룰를 식별하기 위해 노력하고 있습니다. 우리는 또한 질병 저항성의 메커니즘 (ISO-Seq, RNA-Seq 등)을 명확히하기 위해 여러 농작물 종에 적용될 수있는 새로운 슬롯 머신 룰형 분석 시스템을 개발하고 있습니다. 작물 품종을 보호하기 위해 실제 현장 사이트에서 사용할 수있는 다양한 식별 기술을 개발하기 위해 노력하고 있습니다.

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  • 교수 : Kadota Yuki 교수 Monden Yuki
  • 이메일 : y_monden [at] okalama-u.ac.jp
  • 특수 : 고구마/식물 슬롯 머신 룰 육종/슬롯 머신 룰 분석/NGS/고차 다소 배수/야채 식별/DNA 마커

연구원 목록
게놈 전체 다형성 분석을 사용하여 농업 특성과 관련된 슬롯 머신 룰 영역의 식별

다양한 고구마 품종과 균주

고구마는 배수성 (hexpolar) (2N = 6x = 90)의 특징을 가지고있어 유 전적으로 복잡한 상속 방식을 분석하기가 매우 어렵습니다. 우리는 NGS를 사용하여 이러한 슬롯 머신 룰 복잡한 고구마에 대한 대규모 슬롯 머신 룰 분석을 수행합니다. 실제로, 최근의 연구 결과는 고구마 수율과 외관 품질에 중대한 영향을 미치는 유해 선충과 바구미 저항성과 관련된 슬롯 머신 룰 영역을 찾는 데 성공했습니다! 결핵 색 및 수율과 관련된 슬롯 머신 룰 영역도 발견되었습니다. 이 정보를 사용하여 저항성 개체를 빠르게 선택할 수있는 DNA 마커 개발을 위해 노력하고 있습니다.

 

질병 저항의 메커니즘을 밝히기위한 슬롯 머신 룰 발현 분석
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발현 변수 슬롯 머신 룰

큰 선충 인 고양이 선충과 바구미에 대한 고구마가 어떻게 저항하는지에 대해 큰 것으로 알려져 있습니다. 따라서, 우리는 내성 및 민감한 품종을 사용하여 슬롯 머신 룰 발현을 종합적으로 조사하는 전 사체 분석을 수행합니다. 이것은 저항을 조절하거나 저항의 메커니즘에 대한 통찰력을 얻는 슬롯 머신 룰를 식별하고 싶습니다. 이 정보를 사용하면 내성 품종의 효율적인 개발이 가능해 질 것으로 예상됩니다.

 

레트로 트랜스 포슨 삽입 사이트를 사용한 작물 품종 식별 기술 개발
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레트로 트랜스 포슨 마커

작물 품종 식별은 고품질 품종의 보호와 관련된 중요한 테스트입니다. 최근 몇 년 동안 일본에서 자란 고품질 품종은 허가없이 해외로 데려 왔으며, 표절, 허위 진술, 심지어 일본으로의 수입을 초래했습니다. 따라서 우리는 이러한 상황을 예방하고 귀중한 농업 품종을 보호하기 위해 다양한 식별 기술을 개발하기 위해 노력하고 있습니다. 공동 연구를 통해 우리는 고구마, 사과, 딸기, 감귤류, 포도 및 밀을 포함한 다양한 농작물 종에 대한 기술을 개발하고 있습니다. 우리는 레트로 트랜스 포손이라는 복제 된 DNA 서열의 삽입 부위에 대한 정보를 사용하여 품종을 쉽고 정확하게 식별 할 수있는 기술을 개발하고 있습니다.

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보도 자료 목록

  • (2023 년 5 월 9 일)

  • (2020 년 6 월 24 일)

  • (2020 년 3 월 13 일)

  • (2014 년 8 월 8 일)

  • (2014 년 8 월 8 일)

 

최근 주요 성능
  1. 8 개의 유명한 일본 감귤류 품종에 대한 크로마토 그래피 인쇄 배열 스트립 방법을 기반으로 한 대상 품종 별 식별 시스템. Okamoto, M., Monden, Y., Shindo, A., Takeuchi, T., Endo, T., Shigematsu, Y., Takasaki, K., Fujii, H. 및 Shimada, T. Breeding Science, in Press (2023).
  2. Transposon의 포괄적 인 설문 조사mping쌀의 높은 단백질 함량을 제어하는 ​​후보 슬롯 머신 룰를 식별하기위한 삽입 부위 및 전 사체 분석. Monden, Y., Tanaka, H., Funakoshi, R., Sunayama, S., Yabe, K., Kimoto, E., Matsumiya, K. 및 Yoshikawa, T., Plant Science의 프론티어, 13, 969582, (2022).
  3. 차세대 시퀀싱 기반 연관 연구를 사용하여 hexaploid sweetpotato에서 선충 저항의 매핑. Obata, N., Tabuchi, H., Kurihara, M., Yamamoto, E., Shirasawa, K. 및 Monden, Y., 식물 과학의 프론티어, 13, 858747, (2022).
  4. 밀 및 관련 종의 유전체 분석 및 진화 연구를위한 효율적인 DNA 마커 시스템으로서 소형 반전 반복적 인 트랜스 포지티브 요소 삽입 다형성을 악용한다. Ubi, B.E., Gorafi, Y.S.A., Yaakov, B., Monden, Y., Kashkush, K. 및 Tsujimoto, 식물 과학의 H. 프론티어, 13, 995586, (2022).
  5. Transcriptome Analysis는 Hexaploid sweetpotato의 바구미 내성과 관련된 주요 슬롯 머신 룰를 보여줍니다. Nokihara, K., Okada, Y., Ohta, S. 및 Monden, Y. Plants, 10, 1535-1535, (2021).
  6. 저지가 낮은 NGS 기반 슬롯 머신 룰형 데이터를 갖춘자가 엑소 로이드 고구마에서의 슬롯 머신 룰 매핑. Yamamoto, E., Shirasawa, K., Kimura, T., Monden, Y., Tanaka, M. 및 Isobe, S. G3, 10, 2661-2670 (2020).
  7. QTL Genome Wide SNP를 사용하여 Sweetpotato (Ipomoea batata)에서 농업용 특성의 QTL 분석 및 GWA. Haque, E., Tabuchi, H., Monden, Y., Suematsu, K., Shirasawa, K., Isobe, S. 및 Tanaka, M. Breeding Science, 70, 283-291 (2020).
  8. 54142_54476
  9. Sweetpotato에서 정량적 특성 슬롯 머신 룰좌 분석 및 게놈 전체 연관 연구를 수행함으로써 Meloidogyne incognita에 대한 내성과 관련된 분자 마커의 개발. Sasai, R., Tabuchi, H., Shirasawa, K., Kishimoto, K., Sato, S., Okada, Y., Kuramoto, A., Isobe, A., Tahara, M. 및 Monden, Y. DNA Research, 26, 399-409 (2019).
  10. 고구마의 수율 및 바구미 내성에 대한 게놈 전체 연관 연구 (GWAS) (Ipomoea Batatas (L.) Lam). Okada, H., Monden, Y., Nokihara, K., Shirasawa, K., Isobe, S. 및 Tahara, M. Plant Cell Report, 38, 1383-1392 (2019).
동문 및 온라인 슬롯 머신 룰 경력 경로

온라인 슬롯 머신 룰, 전국 공무원 (농업, 임업 및 어업부, 특허청, 국가 세금 기관 등), 지역 공무원 (Okaama 현, Tottori 현, Kumamoto 현 등), Kagawa Prefcture 등, 연구원, 국제 대학교 (Tottori retalital retalites) 제조업체, 식품 회사, 화학 분석 제조업체, 은행, IT 관련 회사 등

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